В ходе консультаций обсуждены вопросы развития воздушного сообщения между странами. По итогам внесены дополнения в таблицу маршрутов Приложения к Соглашению между Правительством Российской Федерации и Правительством Литовской Республики о воздушном сообщении от 18 ноября 1993 г.

С января 2009 года литовская авиакомпания «Fly LAL» прекратила осуществлять полеты в Россию в связи с банкротством. В настоящее время полеты по маршруту Москва – Вильнюс – Москва выполняет российская авиакомпания «ЮТэйр» с частотой 7 раз в неделю. С июня 2009 года авиакомпания планирует начать полеты в Палангу.