В Ханты-Мансийском автономном округе в целях реализации Федеральной целевой программы «Модернизация транспортной системы России» осуществляются мероприятия на региональном уровне: разрабатываются программы «Развитие пассажирского автомобильного транспорта на территории ХМАО до 2005 года», «Развитие водного транспорта и поддержание внутренних водных путей ХМАО на период до 2010 года». В округе также разработана и действует  «Концепция развития гражданской авиации ХМАО на период 2001-2010 гг.». Ведется строительство автодороги Томск-Ханты-Мансийск-Серов, входящей в общую схему подпрограммы «Международные транспортные коридоры».