- Счетной палатой Российской Федерации в 2023 году в Министерстве транспорта Российской Федерации проведены контрольные мероприятия:

• «Аудит государственной информационной системы «Единая государственная информационная система обеспечения транспортной безопасности» за период с 2020 по 2022 год и истекший период 2023 года (при необходимости за более ранний период)».
• «Проверка исполнения Федерального закона «О федеральном бюджете на 2022 год и на плановый период 2023 и 2024 годов» и бюджетной отчетности об исполнении федерального бюджета за 2022 год».
• «Проверка обоснованности планирования расходов проекта федерального бюджета на 2024 год и на плановый период 2025 и 2026 годов, нормативной и методической базы их формирования».
• «Аудит использования средств федерального бюджета, выделенных на реализацию мероприятий по строительству судов морского и речного флота в 2020–2022 годах и истекшем периоде 2023 года».

- Федеральным казначейством в 2023 году в Министерстве транспорта Российской Федерации проведена плановая выездная проверка соблюдения законодательства Российской Федерации и иных правовых актов о контрактной системе в сфере закупок товаров, работ, услуг для обеспечения государственных и муниципальных нужд в отношении отдельных закупок для обеспечения федеральных нужд.

Результаты проведенных в Минтрансе России проверок. По результатам проведенных в 2023 году в Министерстве транспорта Российской Федерации проверок Счетной палатой Российской Федерации и Федеральным казначейством направлены представления, предписания не выносились, бюджетные меры принуждения не применялись.