подготовка предложений по координации и взаимодействию в области обеспечения транспортной безопасности;

взаимодействие с законодательными (Государственная Дума, Совет Федерации Федерального Собрания Российской Федерации), исполнительными (Администрация Президента и Правительство Российской Федерации), судебными органами (Верховный Суд Российской Федерации, Верховный арбитражный суд), органами управления (Государственный Совет, Совет Безопасности) и другими федеральными органами исполнительной власти в области обеспечения транспортной безопасности;

подготовка предложений по гармонизации в международную систему обеспечения транспортной безопасности;

координация деятельности ФГУП «УВО Минтранса России» и ФГП «ВО ЖДТ России» по вопросам обеспечения транспортной безопасности;

координация и организация работы по вопросу контроля в пунктах пропуска через Государственную границу Российской Федерации.

разрабатывает межведомственные и ведомственные планы, соглашения и иные документы по вопросам взаимодействия в области обеспечения транспортной безопасности, включая предложения по взаимодействию федеральных органов исполнительной власти в области обеспечения транспортной безопасности;

принимает участие в разработке нормативных правовых актов подготовке проектов заключений, официальных отзывов и предложений по проектам законов, нормативных правовых актов Президента Российской Федерации и Правительства Российской Федерации, поступивших в Министерство от федеральных органов исполнительной власти, Правительства Российской Федерации и Президента Российской Федерации по вопросам, относящимся к компетенции Отдела;

участвует в пределах своей компетенции в согласовании ежегодного плана и показателей деятельности федеральной службы и федеральных агентств, находящихся в ведении Министерства, а также отчета об их исполнении;

готовит предложения к проектам национальных, федеральных целевых, ведомственных и иных программ (подпрограмм) по вопросам транспортной безопасности;

осуществляет анализ хода выполнения национальных, федеральных целевых, ведомственных и иных программ (подпрограмм) в части, касающейся компетенции Отдела, вносит предложения по корректировке позиций программ;

организует и осуществляет в Министерстве выполнение поручений Президента Российской Федерации и Правительства Российской Федерации по вопросам, отнесенным к компетенции Отдела.