Департамент транспортной безопасности и специальных программ Министерства транспорта Российской Федерации (далее – Департамент) создан на основании Приказа Минтранса России от 9 октября 2007 г. N 145 "О структуре центрального аппарата Министерства транспорта Российской Федерации".

Приказом Минтранса России от 23января 2008 г. № 8 утверждено Положение, определяющее задачи и функции, а также права и обязанности Департамента.

Департамент является самостоятельным структурным подразделением центрального аппарата Минтранса России.

Деятельность Департамента координирует и контролирует заместитель Министра, а в части обеспечения режима секретности, мобилизационной подготовки и мероприятий гражданской обороны - Министр транспорта Российской Федерации.

Основной целью создания структурного подразделения в центральном аппарате Минтранса России явилось выполнение требований Федерального закона от 9 февраля 2007 г. №16-ФЗ «О транспортной безопасности», установившего правовые основы деятельности по обеспечению безопасности объектов транспортной инфраструктуры и транспортных средств от актов незаконного вмешательства, в т.ч. террористической направленности.

В рамках требований данного Федерального закона, в обязанности Департамента вменено решение следующих задач:

1) формирование государственной политики в области транспортной безопасности;

2) разработка проектов законодательных и иных нормативных правовых актов в области транспортной безопасности;

3) координация и контроль деятельности подведомственных Министерству федеральной службы и федеральных агентств в области обеспечения транспортной безопасности;

4) интеграция в международную систему обеспечения транспортной безопасности.

Кроме того, Департамент осуществляет решение задач по обеспечению мобилизационной подготовки в области транспорта, мероприятий по гражданской обороне, обеспечению режима секретности и ведению секретного делопроизводства в Министерстве).

В целях решения указанных выше задач, а также во исполнении Постановления Правительства РФ №354 от 22 апреля 2009г. «О внесении изменений в некоторые постановления Правительства РФ по вопросам транспортной безопасности» в структуре Департамента создано три отдела, в сферу ответственности которых включены вопросы нормативного обеспечения транспортной безопасности, мониторинга и анализа государственной политики в области обеспечения транспортной безопасности, координации и взаимодействия в области обеспечения транспортной безопасности.

Указанным выше Постановлением Правительства федеральным агентствам по видам транспорта подконтрольным Минтрансу России переданы функции по оказанию государственных услуг в области обеспечения транспортной безопасности, а Федеральной службе по надзору в сфере транспорта - функции по контролю и надзору за обеспечением транспортной безопасности. В связи с передачей функций в структуре федеральной службы и федеральных агентств созданы Управления транспортной безопасности. В настоящее время ведется работа по комплектованию Управлений и их территориальных органов профессиональными кадрами.